Les cétacés de méditerranée sont séparés en deux groupes : les Mysticètes et les Odontocètes.

Les Mysticètes, nom qui provient du grec "moustache", regroupe les "baleines" ou cétacés à fanons. Ce sont des animaux qui se nourrissent de krill principalement (crevettes). Ils utilisent leurs fanons comme un peigne pour filtrer les énormes quantités d'eau de mer qu'ils engloutissent dans leur bouche. Deux espèces sont présentes en Méditerranée : le rorqual commun (Balaenoptera physalus) est fréquent, le petit rorqual (Balaenoptera acutorostrata) est beaucoup plus rare.

Les Odontocètes regroupent les cétacés à dents. C'est le groupe le plus nombreux dans lequel on retrouve les dauphins, les cachalots, globicéphales, etc.. Leur régime alimentaire est principalement constitué de calmars (on dit qu'ils sont teutophages) et de poissons (Ichtyophages) pour le Grand Dauphin et le dauphin Blanc et Bleu.

Chez les Mysticètes les femelles sont plus grandes que les mâles, tandis que c'est le contraire pour les Odontocètes.